莊閑和游戲 一文搞定:COX模型的校準曲線(2種方法+訓練集+外部驗證集)
2026-01-14??專注R語言在??生物醫學中的使用 設為“星標”,精彩不錯過 前面我們已經講過邏輯回歸模型的校準曲線的畫法,這次我們學習cox回歸的校準曲線畫法。 準備數據 使用自帶數據lung數據集進行演示。 這個是關于肺癌的生存數據,一共有228行,10列,其中time是生存時間,單位是天,status是生存狀態,1是刪失,2是死亡。其余變量是自變量,意義如下: inst:機構代碼,對于我們這次建模沒啥用age:年齡sex:1是男性,2是女性ph.ecog:ECOG評分。0=無癥狀,1=有癥狀但完全可以走動
莊閑和游戲 孟德爾隨機化R包TwoSampleMR安裝教程并設置token
2026-01-14大家好,我是鄧飛,今天介紹一下TwoSampleMR包如何設置token,從而可以使用數據庫的數據進行孟德爾隨機化的分析。 1,安裝TwoSampleMR包 這個包在github上面,之前流行用devtools包安裝github上的R包,但是devtools本身就特別難安裝,好在現在有了 remotes包,這個包比較好安裝,進而github上面的包也比較好安裝了。 # install.packages("remotes")library(remotes)install_github("MRCI
莊閑和游戲 電腦必裝的四款神仙軟件,趕快卸載那些沒用的流氓軟件吧
2026-01-14俗話說得好,手巧不如家什妙! 這句話的意思是人的手再靈 巧,也不如有好的工具。手藝再好,也得靠趁手或先進的工具幫忙。 第一款FastStone Capture {jz:field.toptypename/} 圖片 FastStone Capture是一款體積小巧卻功能強大、簡單易用的屏幕捕捉工具。 它集屏幕截圖、圖像編輯與視頻錄制等功能于一身。能夠捕捉屏幕上的任意區域,提供多種捕獲方式,如活動窗口、指定窗口/對象、矩形區域、手繪區域、整個屏幕、滾動窗口等。此外,還附帶屏幕錄像機、放大鏡、取色器
莊閑和游戲 肺腺癌單細胞數據集GSE189357復現(三):基因可視化
2026-01-14圖片 前言 Hello小伙伴們大家好,我是生信技能樹的小學徒”我才不吃蛋黃“。今天是肺腺癌單細胞數據集GSE189357復現系列第三期。第二期我們對細胞亞群進行了注釋(肺腺癌單細胞數據集GSE189357復現(二):細胞注釋)。 本期,我們將使用多種可視化方法,繪制FeaturePlot,ggplot,DoHeatmap圖。 1.背景介紹 在胃癌系列推文中,我提到繪好看圖需要審美能力強。實際上,繪圖能力也能很好的反映我們的科研素養。繪圖能力與科研能力之間的關系非常緊密,因為有效的可視化在科學研
莊閑和游戲 使用小提琴圖可視化目的基因并計算顯著性
2026-01-14前情回顧 在這個月的前幾期推文中,主要基于單細胞數據使用小提琴圖可視化marker基因進行了整理: VlnPlot結果及常用參數淺析 基于VlnPlot參數及ggplot2美化小提琴圖 也有一期答讀者問——小提琴圖有點無圖是何緣由? 這期就一起來學習一下畫目的基因的小提琴圖并計算顯著性! 小提琴圖可視化并計算顯著性用途 在單細胞數據分析中,通過小提琴圖可視化和顯著性計算可以幫助研究者直觀且統計地評估目的基因在不同細胞群體中的表達差異 展示基因在不同細胞群體的表達分布:小提琴圖可以直觀地展示基因
好了,寫了好幾篇的聚類,有同學都在問蝦神,說沒想到你這個濃眉大眼的家伙也當叛徒了,背叛了空間統計學隊伍……好吧,還是那句話,空間統計學是蝦神的看家本領,所以那是肯定不能丟掉的。 當然,今天我們要講的還是聚類,不過是妥妥的空間聚類。 話說,前面一直都在強調,空間分布模式主要就是三種: {jz:field.toptypename/} 圖片 而全局的莫蘭指數可以通過計算公式,來表明整個研究空間中的樣本數據所表達出來的總體特征,但是這個總體特征是所有模型加權出來的結果,自然就會掩蓋掉里面的很多細節。
莊閑和游戲 R包推薦Liana:受配體分析框架-多種分析方法整合
2026-01-14建站客服QQ:88888888 作者建議:We recommend all users to consider using [LIANA+](https://liana-py.readthedocs.io/en/latest/index.html), instead of LIANA, due to it's increased efficiency and completeness. We plan to eventually port all LIANA+ functionalit
莊閑和游戲 如何隱藏和保護上網隱私與瀏覽器記錄?
2026-01-14發現現在大家都開始重視起了個人上網隱私問題!很好!畢竟,誰都不希望自己的上網蹤跡被肆意窺探,個人數據無端泄露。下面整理了一些實用的保護網隱私與數據安全方法,以下這些實用建議值得參考: 圖片 1. 啟用隱私模式瀏覽網頁 幾乎所有主流瀏覽器,像是Chrome、Firefox、Safari 等,均貼心地設有隱私或無痕模式。開啟該模式后瀏覽網頁,瀏覽器便不會留存您的歷史記錄、Cookie 以及網站數據。換言之,待您關閉瀏覽器窗口的瞬間,那些瀏覽痕跡統統會被一鍵刪除,旁人自然沒機會查看您的上網軌跡。 不
莊閑和游戲 241,DeepSeek 新手入門使用教程(2025最新版)
2026-01-14一、快速訪問與賬號注冊 1.網頁版入口瀏覽器訪問DeepSeek官網(deepseek.com) ,點擊「開始對話」按鈕即可使用基礎功能。國內用戶無需VPN,加載慢時可配合迅游加速器優化網絡。 {jz:field.toptypename/} 2.手機端使用 應用商店搜索「DeepSeek」下載APP(支持iOS/安卓)。微信用戶可直接通過小程序使用。 3.注冊與登錄 新用戶需手機號/郵箱注冊,接收驗證碼完成驗證。支持微信一鍵登錄(推薦手機端)。二、基礎功能使用指南 1.智能問答在輸入框直接提問
莊閑和游戲 236,普通人也能輕松上手!DeepSeek 使用指南
2026-01-14你是否曾經遇到過這些問題: - 想快速了解某個知識點,但不知道從哪里開始? - 需要處理一份文件,但覺得太復雜無從下手? - 想寫一篇文章或郵件,卻不知道如何組織語言? 別擔心,DeepSeek 就是為你準備的!它是一款智能助手,可以幫助你解決這些問題。即使你完全不懂技術,也能輕松上手。下面,我將從普通人的角度,帶你一步步了解如何使用 DeepSeek。 圖片 1. 什么是 DeepSeek? DeepSeek 是一款基于人工智能的工具,你可以把它想象成一個“萬能助手”。它能回答你的問題、幫你
















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